朱由校并没有在南直隶待太久，江南繁华，最能磨灭英雄锐气，朱由校自认意志尚不够坚定，所以只是稍作停留。
话说南巡舰队自山东莱州出海后，南下至淮安府盐城县停靠，在休整了一天后继续南下，天启二年十一月一十九日从松江府顺流进入扬子江。
江苏以下江段又称扬子江，江阴以下河段江面逐步开阔，向入海口呈喇形状开展，入海口附近时江面宽达80公里，饶是朱由校前世在视频上见过，但此时也不由得惊叹，他第一次感受到什么叫“长江如虹贯”，在众人所拥护下站在船头，凭栏远眺。
其实朱由校产生这样的震撼心理是很正常，因为现代人早就看不到这样壮丽的景象了。明代时期镇扬河段和江阴河段江面宽都在10千米以上，而今分别缩为2.3千和1.5千米，可谓天差地别。
“陛下，大抵明日丑时（3点左右）即可到达南京。”负责护卫的武将前来向朱由校通报。
“嗯，不急，先在江阴停靠一下吧。”
“是，陛下，今日下午即到江阴。”
“嗯，你下去。”
那武将后撤步走了出去，先将皇帝的命令吩咐给了掌舵的，待走远了后一路小跑，跑到他同僚旁边。
“又要出事了。”
“怎么？陛下刚才说什么了？”
“陛下说先不去南京，要去江阴。”
“这不很正常吗？江阴北枕长江，南近太湖，东接常熟，西连常州，是江海联运的交通枢纽，又为拱卫南京之要塞；扼江海门户，捍卫全吴。陛下想要巡视冮南，那临幸江阴自然也是应有之义。”
“问题就出在这儿：江阴是江南之军事重镇，但你还记得江阴防务上次修茸是什么时候吗？”
“呃……大抵得有四、五十年了吧？”
“四、五十年？少了！江阴要塞上次加固还是嘉靖年间防范倭乱的时候，到现在都他妈快七十年了！”
（历史上，江阴城防下一次翻修是崇祯八年，并且用上了新式、仿制西方的火铳和火炮。）
“……”另一个人沉默了，武备松弛、兵事糜烂是当今大明的常态，南方更是久未经战，而现在，皇上下午就到，无论如何都是来不及了。
“在辽东就杀了好几个，不过都是管理仓库的小鬼；在朝鲜，你是没下船啊，一进城，那血腥味都冲鼻子；也就在山东没有见血；这次…”
“行了，噤声！”那人看了看左右，确定身旁无人后，才小声的说道：“你是忘了锦衣卫就在旁边吗？慎言，自己想死就算了，别害我和一家老小。”
于是对话便以这样不愉快的形式硬生生地打断了。
不过众人不知道的事，朱由校前去江阴并不仅仅是查看城防工事这么简单，也是因为他想好好祭拜一下这个“忠义之邦”。
江阴，两宋时因为其重要的地理位置，升格为江阴军，岳飞、韩世忠、辛弃疾都曾驻守于此。
正德年间刘瑾误国，在朝的三位江阴人——黄昭、贡安甫、史良佐，或以挽死谏，世称之为“江阴一时三忠”。
而在原本的历史中，清军肆虐江南，唯江阴坚持“头可断，发决不可剃”的民族气节。“八十曰戴发效忠，十万人同心死义”，击毙清军7万5千余人，斩亲王36名，杀名将72名，最后城破，屠城，无一人降：城内死者九万七千余人，城外死者七万五千余人，城中生者唯有躲在寺观塔上隐僻处的以及和尚印白等，共计大小五十三人。
民国时期，孙中山先生更是留下了“全国的文明，从江阴发起“的倡言。
所以朱由校对此次的江阴之行充满了期待。然而，同日下午，期待破灭了。朱由校看着破败的城防大骂不止，虽然没有任何人斧钺加身，但显然，它们的政治生命基本上已经也走到了尽头。
天启二年十一月二十日，大明皇帝朱由校来到了大明陪都南京，毫不意外的朱由校来南京的第一件事便是拜明孝陵。
这是他这辈子第一次来到南京，但是他上一次是来过南京一次。但那时是跟团旅游，所以并没有见过孝陵的样子，那次他去参观的是另一位喊出“驱除鞑虏，恢复中华”的伟人的陵寝。
从朝阳门(今中山门)至孝陵卫到陵墓西北所筑的皇墙有45华里长，护陵驻军有5千多人。“陵园内亭阁相接，享殿中烟雾缭绕，松涛林海，养长生鹿千头。鹿鸣其间，气势非凡。”理论上，应该是这样。
但朱由校所看见的是一支松散的军队，古老的建筑发出破败的气息，就像这个王朝一样；长生鹿早就不知道去了哪里，追等待着天下英雄的追逐。
有明一代，南京明孝陵一直是祖宗根本之地，备受尊崇。每岁有固定三大祭、五小祭。凡遇国之大事，均需遣勋戚大臣祭告。
即便如此，孝陵仍有杂草与破损，看到这里，朱由校的心态己然是变了。
天气二年11月25日，皇帝坐船前往了福建。
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